Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1bA1Z198 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms