Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms