Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RNP2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms