Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4921501E09RikA0A0R4J054 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4921501E09RikA0A0R4J054 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms