Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms