Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms