Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y3

Ighv1-80, Immunoglobulin heavy variable 1-80 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-80A0A075B5Y3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms