Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ChmQ9QXG2 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ChmQ9QXG2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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