Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Trim39Q9ESN2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Trim39Q9ESN2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Trim39Q9ESN2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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