Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Wdr61Q9ERF3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Wdr61Q9ERF3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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