Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms