Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms