Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D4W2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D4W2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms