Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pus10Q9D3U0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pus10Q9D3U0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pus10Q9D3U0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pus10Q9D3U0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pus10Q9D3U0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pus10Q9D3U0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pus10Q9D3U0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pus10Q9D3U0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pus10Q9D3U0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pus10Q9D3U0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pus10Q9D3U0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pus10Q9D3U0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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