Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TpbpbQ9CQC0 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms