Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms