Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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