Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Amigo3Q8C2S7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Amigo3Q8C2S7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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