Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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