Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
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