Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
IfnkQ7TSL0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms