Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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