Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms