Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trp53i11Q4QQM4 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms