Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cldn34b4Q3V0X2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cldn34b4Q3V0X2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cldn34b4Q3V0X2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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