Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Top2aQ01320 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms