Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms