Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps3aP97351 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps3aP97351 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms