Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms