Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl27P61358 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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