Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TspoP50637 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TspoP50637 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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