Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SftpdP50404 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms