Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csn1s1P19228 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.2 ms