Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18528 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18528 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18528 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18528 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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