Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms