Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ptpn20O55082 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms