Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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