Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp988F6VKC7 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms