Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc2lQ9JME7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms