Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trim39Q9ESN2 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Trim39Q9ESN2 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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