Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ube3bQ9ES34 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ube3bQ9ES34 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube3bQ9ES34 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms