Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ddx28Q9CWT6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ddx28Q9CWT6 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms