Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atxn3Q9CVD2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atxn3Q9CVD2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atxn3Q9CVD2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atxn3Q9CVD2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn3Q9CVD2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atxn3Q9CVD2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atxn3Q9CVD2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atxn3Q9CVD2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atxn3Q9CVD2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atxn3Q9CVD2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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