Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ncbp2Q9CQ49 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms