Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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