Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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