Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms