Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf19Q99KP6 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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