Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rdh10Q8VCH7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms