Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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SbsnQ8CIT9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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